Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAV3P56539 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAV3P56539 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms