Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms