Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA5P52803 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA5P52803 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms