Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A2P52657 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A2P52657 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A2P52657 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A2P52657 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A2P52657 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A2P52657 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A2P52657 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A2P52657 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A2P52657 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A2P52657 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A2P52657 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A2P52657 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A2P52657 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A2P52657 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A2P52657 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A2P52657 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A2P52657 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A2P52657 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A2P52657 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A2P52657 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A2P52657 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A2P52657 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A2P52657 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms