Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms