Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP2P50120 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP2P50120 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP2P50120 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP2P50120 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP2P50120 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBP2P50120 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms