Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms