Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP4P49662 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CASP4P49662 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP4P49662 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms