Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME1P48163 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME1P48163 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME1P48163 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME1P48163 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME1P48163 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME1P48163 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME1P48163 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME1P48163 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME1P48163 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME1P48163 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME1P48163 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME1P48163 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ME1P48163 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME1P48163 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME1P48163 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME1P48163 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME1P48163 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME1P48163 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME1P48163 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME1P48163 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME1P48163 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME1P48163 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME1P48163 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME1P48163 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME1P48163 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME1P48163 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME1P48163 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME1P48163 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME1P48163 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME1P48163 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME1P48163 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ME1P48163 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME1P48163 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME1P48163 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ME1P48163 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME1P48163 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME1P48163 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ME1P48163 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME1P48163 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME1P48163 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME1P48163 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME1P48163 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms