Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms