Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms