Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms