Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms