Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms