Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB2P29033 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB2P29033 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJB2P29033 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJB2P29033 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJB2P29033 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJB2P29033 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB2P29033 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB2P29033 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB2P29033 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB2P29033 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB2P29033 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB2P29033 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB2P29033 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB2P29033 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB2P29033 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB2P29033 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB2P29033 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB2P29033 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB2P29033 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB2P29033 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB2P29033 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB2P29033 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB2P29033 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB2P29033 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB2P29033 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms