Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD1P28340 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD1P28340 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD1P28340 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD1P28340 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD1P28340 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD1P28340 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD1P28340 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD1P28340 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD1P28340 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD1P28340 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD1P28340 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD1P28340 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD1P28340 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD1P28340 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLD1P28340 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLD1P28340 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLD1P28340 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLD1P28340 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLD1P28340 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLD1P28340 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLD1P28340 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLD1P28340 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLD1P28340 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLD1P28340 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLD1P28340 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLD1P28340 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLD1P28340 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLD1P28340 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLD1P28340 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLD1P28340 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLD1P28340 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLD1P28340 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLD1P28340 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLD1P28340 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLD1P28340 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLD1P28340 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLD1P28340 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLD1P28340 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLD1P28340 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLD1P28340 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLD1P28340 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLD1P28340 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLD1P28340 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLD1P28340 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLD1P28340 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLD1P28340 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLD1P28340 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLD1P28340 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLD1P28340 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLD1P28340 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLD1P28340 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLD1P28340 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLD1P28340 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLD1P28340 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLD1P28340 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLD1P28340 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLD1P28340 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLD1P28340 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLD1P28340 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLD1P28340 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLD1P28340 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLD1P28340 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLD1P28340 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLD1P28340 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLD1P28340 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLD1P28340 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLD1P28340 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLD1P28340 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLD1P28340 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLD1P28340 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLD1P28340 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLD1P28340 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLD1P28340 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLD1P28340 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLD1P28340 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLD1P28340 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLD1P28340 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLD1P28340 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLD1P28340 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLD1P28340 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLD1P28340 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLD1P28340 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLD1P28340 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLD1P28340 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLD1P28340 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLD1P28340 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLD1P28340 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLD1P28340 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLD1P28340 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLD1P28340 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLD1P28340 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLD1P28340 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
POLD1P28340 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLD1P28340 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLD1P28340 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms