Protein–RNA interactions for Protein: P27708

CAD, CAD protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADP27708 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CADP27708 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADP27708 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADP27708 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADP27708 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADP27708 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADP27708 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADP27708 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADP27708 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADP27708 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADP27708 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADP27708 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADP27708 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADP27708 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CADP27708 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CADP27708 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADP27708 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADP27708 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADP27708 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADP27708 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms