Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms