Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALB2P22676 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALB2P22676 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALB2P22676 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALB2P22676 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALB2P22676 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALB2P22676 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALB2P22676 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALB2P22676 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALB2P22676 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALB2P22676 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALB2P22676 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALB2P22676 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALB2P22676 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALB2P22676 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALB2P22676 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CALB2P22676 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALB2P22676 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CALB2P22676 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALB2P22676 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALB2P22676 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALB2P22676 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALB2P22676 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALB2P22676 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALB2P22676 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CALB2P22676 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALB2P22676 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALB2P22676 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALB2P22676 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALB2P22676 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALB2P22676 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALB2P22676 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALB2P22676 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALB2P22676 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALB2P22676 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALB2P22676 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALB2P22676 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALB2P22676 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALB2P22676 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALB2P22676 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms