Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms