Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms