Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms