Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDSP20132 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDSP20132 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDSP20132 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDSP20132 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SDSP20132 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDSP20132 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDSP20132 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDSP20132 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDSP20132 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDSP20132 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDSP20132 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDSP20132 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDSP20132 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDSP20132 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDSP20132 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDSP20132 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDSP20132 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDSP20132 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDSP20132 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDSP20132 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDSP20132 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDSP20132 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDSP20132 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDSP20132 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDSP20132 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDSP20132 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDSP20132 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDSP20132 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDSP20132 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDSP20132 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDSP20132 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDSP20132 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDSP20132 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDSP20132 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDSP20132 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SDSP20132 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDSP20132 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDSP20132 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDSP20132 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDSP20132 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDSP20132 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDSP20132 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDSP20132 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDSP20132 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDSP20132 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDSP20132 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDSP20132 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDSP20132 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDSP20132 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDSP20132 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDSP20132 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDSP20132 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SDSP20132 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDSP20132 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDSP20132 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDSP20132 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDSP20132 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDSP20132 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDSP20132 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDSP20132 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDSP20132 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDSP20132 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDSP20132 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDSP20132 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDSP20132 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDSP20132 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDSP20132 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDSP20132 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDSP20132 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDSP20132 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDSP20132 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDSP20132 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDSP20132 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDSP20132 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDSP20132 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SDSP20132 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDSP20132 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms