Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TRIM21P19474 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms