Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
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