Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms