Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX4I1P13073 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms