Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH1P12830 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH1P12830 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH1P12830 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH1P12830 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH1P12830 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH1P12830 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH1P12830 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH1P12830 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH1P12830 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH1P12830 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH1P12830 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH1P12830 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH1P12830 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH1P12830 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms