Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms