Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A1P12074 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms