Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PKHD1P08F94 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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