Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOP08100 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOP08100 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOP08100 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOP08100 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOP08100 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOP08100 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOP08100 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOP08100 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOP08100 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOP08100 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOP08100 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOP08100 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOP08100 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOP08100 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOP08100 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOP08100 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOP08100 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOP08100 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOP08100 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms