Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms