Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms