Protein–RNA interactions for Protein: O15105

SMAD7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD7O15105 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD7O15105 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD7O15105 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD7O15105 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD7O15105 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD7O15105 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD7O15105 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD7O15105 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD7O15105 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms