Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms