Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9YO00507 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9YO00507 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9YO00507 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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