Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DFFAO00273 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DFFAO00273 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms