Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3KR12 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3KR12 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3KR12 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3KR12 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3KR12 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3KR12 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3KR12 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KR12 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KR12 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KR12 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms