Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPIPA5E9PKD4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms