Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms