Protein–RNA interactions for Protein: D6RA61

USP17L22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L22D6RA61 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L22D6RA61 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms