Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L11C9JVI0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms