Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms