Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms