Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms