Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms