Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF839A8K0R7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF839A8K0R7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF839A8K0R7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF839A8K0R7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF839A8K0R7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF839A8K0R7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF839A8K0R7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF839A8K0R7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF839A8K0R7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF839A8K0R7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF839A8K0R7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF839A8K0R7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF839A8K0R7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms