Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms