Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSDA5PKW4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms